В институте исследований генома установлен суперкомпьютер SGI
В институте исследований генома TGen, штат Аризона, США, установлен 64-битный суперкомпьютер SGI Altix 4700 на основе 48 двухъядерных процессоров Intel Itanium.
Суперкомпьютер предназначен для...
В институте исследований генома TGen, штат Аризона, США, установлен 64-битный суперкомпьютер SGI Altix 4700 на основе 48 двухъядерных процессоров Intel Itanium.
Суперкомпьютер предназначен для вычислений в области исследований генов человека и их мутаций, вызывающих развитие различных болезней, в том числе рака. Поиск таких вариаций генов связан с передачей и хранением огромных объемов информации. Так, объем одного файла с данными исследований составляет до 150 Мбайт. Для поиска и сравнения генетических образцов ученым требуется создавать сотни копий таких файлов. Это предъявляет высокие требования к используемым вычислительным мощностям и компьютерной памяти.
В системе используются программы BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) и ClustalW для изучения последовательности нуклеотидов ДНК и аминокислот в белках; и NAMD для изучения молекулярной динамики в биологических системах.