На коже человека обнаружены неизвестные науке бактерии
Поиск методологии
Обычно бактерии, собранные с помощью ватного тампона, переносят на питательную среду (чашки Петри), где даже одна бактерия может дать колонию, морфологические признаки которой и служат основой для идентификации микроорганизмов. Однако на чашках Петри не каждая бактерия дает рост, для этого нужна специально подобранная питательная среда, и, возможно, некоторые бактерии не были открыты именно потому, что нужные для их роста питательные среды не были найдены.
Американские ученые впервые применили для исследования микрофлоры кожи молекулярно-генетические методы, основанные на экстракции из проб субъединицы генетического материала - рибосомальной ДНК - под названием 16S. Для получения специфических для каждого вида генетических фрагментов бактерий были применены традиционные методы молекулярной генетики.
После расшифровки нуклеотидных последовательностей в ДНК ученые обратились к базе данных аналогичных последовательностей для разных видов микроорганизмов. В этой базе данных многие бактерии представлены лишь в виде этих специфических последовательностей, у них нет собственного видового названия, и они никогда не изучались подробно. Ученые называют такие бактерии просто таксономическими единицами видового уровня. Для пояснения напомним таксономическую классификацию - человек, например, относится к типу хордовых, подтипу позвоночных, классу млекопитающих, отряду приматов, семейству гоминид, роду Homo, виду Homo sapiens.
Таксономия и результаты
Исследование показало, что на коже испытуемых присутствовало 182 вида (идентифицируемых в качестве таксономической единицы или известного вида микроорганизма), которые относятся к 91 роду бактерий. Обнаруженные бактерии относились в основном к трем таксономическим типам: Actinobacteria, Firmicutes и Proteobacteria. К этим типам, присутствующим у всех испытуемых, относились 94,6% бактерий. Интересно, что те же три типа преобладают в пищеводе и желудке любого человека.