Городские микробы — опасный неизученный мир

На конференции Нью-Йоркской академии наук и Нью-Йоркского университета (NYU), которая прошла 19 июня 2015 г., ученые объявили о существовании новой Terra Incognita — микробной среды в городах. Исследователи изучили микробную среду в 16 городах мира и выясняли, что 48% обнаруженного генетического материала не совпадают с известными образцами. Таким образом, на кончиках наших пальцев целый мир, нам неизвестный.

Гигантский микробиом городов известен лишь наполовину

В рамках глобальной инициативы MetaSUB (Metadesign of Subways and Urban Biomes initiative) ученые изучили вирусы и бактерии, обитающие в городах. Микроорганизмы в городских условиях живут повсеместно: на тротуарах, в подъездах, квартирах, общественном транспорте, автомобилях, парках, больницах, лифтах и т.д. Кроме того, мириады бактерий и вирусов переносятся городскими крысами, голубями, насекомыми.

Большинство городских микроорганизмов безвредны, лишь небольшая часть может стать причиной смерти или даже болезни. Однако, как выяснилось, почти половина микроорганизмов относится к неизученным видам.

В общественном транспорте огромное количество бактерий живет на пластиковых сидениях и тканевой обивке, а на металлических поручнях их меньше. Микробиомы в домах, как правило, совпадают с таковыми у жителей и быстро меняются после смены жильцов. Ученые обнаружили, что квартиры заселяются микробами новых хозяев всего за 24 часа.

Микробный миргородских грызунов находится в начальной стадии изучения, но у нью-йоркских мышейобнаружены патогенные Helicobacter и Atopobium bacteria, вызывающие язвенную болезнь желудка и бактериальный вагиноз.У крыс найдены:  патогенная кишечная палочка Escherichia coli, Clostridium difficile, Salmonella enterica, а также Сеульский хантавирус, который может быть смертельным при попадании в организм человека.

Но наибольшую тревогу вызывают образцы сточных вод. Например, в образцах взятых в 14 очистных сооружениях Нью-Йорка обнаружилось множество генов устойчивости к антибиотикам. Канализация является идеальной средой для роста микроорганизмов и распространения резистентности.

В целом разнообразие микробов в городской среде растет, как и количество резистентных штаммов. В то же время разнообразие микроорганизмов в организме людей падает, например, в развитых странах у людей вдвое меньше разных защитных бактерий, чем изолированных человеческих групп, таких как племена Яномами из тропических лесов Амазонки.